理研　播磨研究所/マンスリーフォーラム

◆藤　博幸教授（九州大学生体防御医学研究所　付属感染防御研究センター）

日時：	2009年1月21日（水）　13:30～
場所：	構造棟セミナー室AB
演者：	藤　博幸教授（九州大学生体防御医学研究所　付属感染防御研究センター）
（前半）13:30-14:30の予定
演題：	「プロファイル比較による機能部位予測」
要旨：	タンパク質のアミノ酸配列から機能部位を予測する方法として、アラインメントを構築し各サイトの保存を評価するという方法がある。しかし、この方法ではそのサイトが機能的制約のために保存されているのか、構造的制約のために保存されているのかを区別できない。近年、タンパク質の解析において、機能的制約と構造的制約を区別する方法が開発されてきておりその手法の一つにプロファイル比較がある。我々も新規のプロファイル比較法を開発しており、その手法について解説する。
（後半）14:40-15:40の予定
演題：	「機能的制約としての相互作用」
要旨：	タンパク質が進化する中で、そこに作用する機能的制約は、配列が自由に変化することを妨げ、結果として配列の上にパターンが生じる。例えば、モチーフはその典型的な例である。バイオインフォマティクスには様々な比較解析があるが、それは比較を通じて配列などのデータ中に残されたパターンを読み解くことでそこに作用する機能的な制約を推測することを目的としている。タンパク質は、他のタンパク質あるいは低分子リガンドとの相互作用によって機能を発揮するものが多い。今回は、 Streptococcus属のComC-ComDの相互作用、プロスタグランジン合成系へのチオレドキシン様ドメインのリクルートの２つを題材として相互作用が機能的制約として働ている場合の解析を紹介する。

連絡先：	RMF世話人（城生体金属科学研究室：菊地）（城生体金属科学研究室：河野）（宮野構造生物物理研究室：堀）